Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd6ipQ9WU78 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd6ipQ9WU78 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms