Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfsf13bQ9WU72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms