Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ggps1Q9WTN0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ggps1Q9WTN0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms