Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac4Q9R2B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
St6galnac4Q9R2B6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac4Q9R2B6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac4Q9R2B6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac4Q9R2B6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms