Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trex2Q9R1A9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms