Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc26a4Q9R155 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc26a4Q9R155 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms