Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed2Q9R0Q3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed2Q9R0Q3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed2Q9R0Q3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms