Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod3Q9R0E1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod3Q9R0E1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms