Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr54Q9R0D8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms