Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc6Q9R087 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc6Q9R087 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms