Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnnt3Q9QZ47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnnt3Q9QZ47 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms