Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr2e3Q9QXZ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2e3Q9QXZ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms