Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms