Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChmQ9QXG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChmQ9QXG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms