Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trp53inp1Q9QXE4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms