Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt17Q9QWL7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt17Q9QWL7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms