Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chaf1aQ9QWF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms