Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcea2Q9QVN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcea2Q9QVN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168 ms