Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl2Q9QUK0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms