Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnaja4Q9JMC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnaja4Q9JMC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms