Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp2Q9JLK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp2Q9JLK4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp2Q9JLK4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp2Q9JLK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp2Q9JLK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp2Q9JLK4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp2Q9JLK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp2Q9JLK4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms