Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr5Q9JLF7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms