Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gde1Q9JL56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gde1Q9JL56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms