Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a3Q9JKZ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a3Q9JKZ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms