Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx5Q9JKQ4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx5Q9JKQ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx5Q9JKQ4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms