Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrQ9JKK8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrQ9JKK8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms