Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Spag4Q9JJF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spag4Q9JJF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spag4Q9JJF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms