Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx21Q9JIK5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms