Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl11Q9JHH5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cxcl11Q9JHH5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl11Q9JHH5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms