Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1Q9ESG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms