Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube3bQ9ES34 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3bQ9ES34 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms