Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab27aQ9ERI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab27aQ9ERI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab27aQ9ERI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms