Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chst1Q9EQC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chst1Q9EQC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chst1Q9EQC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chst1Q9EQC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms