Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pold3Q9EQ28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pold3Q9EQ28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pold3Q9EQ28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms