Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cpsf1Q9EPU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms