Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms