Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan4Q9DCK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan4Q9DCK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms