Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms