Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NapaQ9DB05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapaQ9DB05 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NapaQ9DB05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms