Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmigd1Q9D7L8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.2 ms