Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt34Q9D646 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms