Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clvs1Q9D4C9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms