Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt44Q9D2Q2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt44Q9D2Q2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms