Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc6bQ9D289 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc6bQ9D289 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms