Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed3Q9D0L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed3Q9D0L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms