Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd1Q9D0E3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd1Q9D0E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd1Q9D0E3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lysmd1Q9D0E3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd1Q9D0E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd1Q9D0E3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd1Q9D0E3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms