Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2e1Q9D0D5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms