Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc47Q9D024 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc47Q9D024 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms