Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CYI0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CYI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms