Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms